瑜珈行者有一項很重要的發現，就是身體錯綜複雜的功能， 是由許多不同的腺體系統來指揮；這些分泌的化學物質，現代科學家稱為荷爾蒙。荷爾蒙對身體產生很大的影響，例如生長、消化、精力、情緒…等；譬如甲狀腺分泌過多的甲狀腺素，會使很正常的人緊張與暴躁。瑜珈體位法可刺激腺體調整荷爾蒙的分泌，進而對人體的身體層面以及心理層面有好的影響。
在瑜珈生理學中，認為人類的五十種心理傾向，如害怕、害羞、生氣…等，都是由沿著脊椎到頭頂的七個脈輪所控制（而脈輪又控制腺體）。由於心靈的渙散、不集中，這些傾向急欲藉由不同的狀態發洩，結果造成心理的不平衡，也使得心靈動盪不安，無法歇息。這些習性、傾向均由腺體所影響，只要我們鍛鍊、調整腺體的分泌，就能控制習性及心理的平衡。
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